Полез смотреть логи, для этого запустил в терминале journalctl -f и закрыл крышку. После просыпания увидел следующие записи:
May 01 20:03:42 dragoncore systemd-logind[711]: Lid closed. May 01 20:03:42 dragoncore systemd-logind[711]: Suspending... May 01 20:03:42 dragoncore NetworkManager[710]:[1588352622.0356] manager: sleep: sleep requested (sleeping: no enabled: yes) May 01 20:03:42 dragoncore NetworkManager[710]: [1588352622.0356] manager: NetworkManager state is now ASLEEP May 01 20:03:42 dragoncore systemd[1]: Reached target Sleep. May 01 20:03:42 dragoncore systemd[1]: Starting Suspend... May 01 20:03:42 dragoncore systemd-sleep[2418]: Suspending system... May 01 20:03:42 dragoncore kernel: PM: suspend entry (deep) May 01 20:03:42 dragoncore kernel: PM: Syncing filesystems ... done.
Значит событие закрывания крышки ноутбука обработал logind, а не xfce4-power-manager.