Я когда-то пробовал считать время в микроконтроллере atmega8, но столкнулся с погрешностью из-за неточности частоты кварцевого резонатора. Тогда у меня была возможность измерить частоту кварца с точностью до килогерцев используя тестер для кварцевых резонаторов или с помощью осциллографа.
Например частоту кварца платы Freeduino 2009 можно измерить подключившись щупом осциллографа к пину XTAL2 в режиме 10Х (если попытаться подключиться щупом без делителя, то программа сразу зависнет).
Осциллограф показывает частоту 16,0 МГц и период 62,4 нс. Если пересчитать период в частоту, то она должна быть 1 / (62,4 * 10^-9) = 16 025 641 Гц.
